Amostras – NGS

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Amostra Recomendada: Sangue total (sangue periférico), coletado via venopunção (venóclise) através de tubo a vácuo (BD vacutainer), EDTA K2E 4ml (tampa violeta). Os tubos plásticos representam método seguro de coleta com reduzido  potencial de quebra do tubo e derramamento das amostras, sendo recomendado para envio via transportadora ou postal. Para a coleta de amostra não é necessário jejum ou qualquer outro preparo.

Amostra Alternativa: Saliva obtida com kit especial para pacientes com deficiência intelectual ou que tenham dificuldade de acesso a serviços laboratoriais. Kits para coleta de saliva contém líquido estabilizante que preserva o DNA inibindo sua degradação e prevenindo a contaminação bacteriana. Entretanto é importante não  comer, beber, fumar ou mastigar chiclete durante 30 minutos antes de coletar a amostra de saliva. Há kits especiais para crianças, sendo um dos recomendados o ORAcollect Pediátrico OC-175 (DNA Genotek). Esses coletores têm uma extremidade com esponja que não deve ser tocada, evitando-se também o contato com qualquer superfície. A amostra de DNA é obtida introduzindo  a esponja tão atrás na boca quanto possível, esfregando por 10 vezes  ao longo das gengivas inferiores em movimentos para frente e para trás. Evite ao máximo esfregar os dentes para evitar excessiva contaminação por bactérias. A criança não deve comer, beber ou mascar chiclete por 30 minutos antes de coletar a amostra oral.

Container Recomendado: Vacutainer K2 EDTA (K2E) 7,2 mg, tampa violeta 4,0 ml; para  obtenção de amostra de saliva há necessidade de kit especial aprovado pelo laboratório (ex. Oragene DNA OG-500 ou ORAcollect Pediátrico OC-175).

Temperatura de Transporte: Sangue deve ser enviado resfriado  a 3^o – 8^o C com gelo químico reciclável e nunca congelado. Saliva  é enviada na temperatura ambiente. A amostra de saliva pode ser enviada usando o sistema postal padrão.

Estabilidade da Amostra: Amostras de sangue são estáveis por até 72 horas desde que a temperatura seja preservada nos níveis entre 3^o a 8^o C. Saliva é estável por meses se for coletada com kits especiais.

Rejeição: Sangue coagulado, congelado ou recebido após 72 horas após sua obtenção será rejeitado. Restrições em relação a extração de DNA da amostra de saliva incluem volume de saliva coletada, contaminante da saliva com bebidas, alimentos, nicotina etc. Não enviar amostras que cheguem entre 6^a feira a domingo em São Paulo

Metodologia: Sequenciamento de Nova Geração (NGS)